I firewall che non hanno natura di dispositivi hardware sono delle vere e proprie applicazioni ed, in quanto tali, possono essere affetti da imperfezioni così come qualsiasi altro prodotto di questo genere.
L'unica differenza con le applicazioni tradizionali è che in questi casi il firewall rappresenta l'ultimo baluardo di difesa per cui se un aggressore riesce a superare questa barriera sfruttando una vulnerabilità specifica del prodotto egli può avere pieno accesso al sistema protetto e compiere di conseguenza ogni tipo di attività.
Per evitare che ciò accada è assolutamente necessario applicare sempre tutte le patch rilasciate dal produttore del software, anche quelle che non sono dirette a risolvere uno specifico problema di sicurezza, dal momento che questa abitudine è in grado di migliorare non soltanto la longevità del prodotto ma anche la sua resistenza intrinseca a forme di attacco più o meno note.
